Researcher Information
研究者基本情報
主な研究課題
所属
研究分野
研究経歴
研究職歴
委員歴/役員歴
学位
出身大学
著作(論文等)
著書
学会発表
その他業績
特許
受賞歴
学会活動
客員教授
researchmap研究分野
共同研究テーマ
学識経験
シーズ集URL
Basic information
Name
OGATA Koji
研究者基本情報
 
主な研究課題
シミュレーションを用いた生体分子のダイナミクスとその機能の解析
計算機を用いた疾患関連蛋白質に作用する薬物の創出
所属
ENG 薬学部薬学科 教授
研究分野
分子設計 Drug design
生物物理 Biophysics
計算機シミュレーション Computer simulation
研究経歴
1994-04 蛋白質立体構造予測・ホモロジーモデリング法の開発に従事
1999-10 計算機を用いたペプチド設計法の開発に従事
2002-06 計算機を用いた化合物設計法の開発に従事
2005-10 蛋白質立体構造を用いた蛋白質変異体の解析の研究に従事
2011-05 光合成蛋白質のダイナミクスと水酸化反応のメカニズムの解明に従事
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2018 組合せ問題に帰着した分子設計法とその応用に関する研究に従事
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研究職歴
1994-04 1999-08 北里大学薬学部 助手
1999-10 2002-05 ブリュッセル自由大学生物学部 ポスドク
2002-06 2005-09 三菱化学株式会社(ゾイジーン(株)出向) 研究員
2005-10 2011-05 トロント小児科病院 計算生物センター 研究員
2011-06 2018-03 理化学研究所 イノベーション推進センター 研究員
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2018 山陽小野田市立山口東京理科大学薬学部 教授
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委員歴/役員歴
 
学位
東京理科大学 理学 博士
出身大学
東京理科大学 修士課程 修了
著作(論文等)
Investigation of cooperative modes for collective molecules using grid-based principal-component analysis. J. Phys. Chem. B. 2021-01 125 4 1072 ENG 1084
Identification of Novel Bacterial Urease Inhibitors through Molecular Shape and Structure Based Virtual Screening Approaches. RSC Adv. 2020-04 10 16061 ENG 16070
Investigation of Pathway for Water Delivery in Photosystem II Protein by Molecular Dynamics Simulation J. Phys. Chem. B. 2019-07 123 6444 ENG 6452
自然知能が提示する究極のエネルギー変換, 光合成 アンサンブル 2018-10 20 4 223 ENG 229
Effect of Atomic Charges on Octanol-Water Partition Coefficient Using Alchemical Free Energy Calculation. Molecules 2018-02 23 425
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Study on Unusual SN2 Mechanism in Methylation of Benzyne through Nickel-Complexation. Phys. Chem. Chem. Phys. 2017-09 19 26926 ENG 26933
Unusual Ionic Bond and Solubility Mechanism of NanPQQ (n = 0–4) Crystals Cryst. Growth Des. 2017-07 17 4118 ENG 4123
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著書
 
学会発表
不均衡なデータに対する分類精度の向上法と副作用情報データベースJADERへの応用 ENG 日本薬学会 2024-03-30
水溶液中の溶質周囲の水の層に関する研究 ENG 日本薬学会 2024-03-30
医薬品副作用データベース(JADER)を用いた医薬品構造と有害事象の関連性の解析 ENG 日本薬学会 2024-03-29
グリッドを用いた主成分分析による分子集団の運動モードの解析 ENG 日本生物物理学会 2023-11-15
スマートグラスを用いた事前実習の効率化に関する山口東京理科大学の取組 ENG 日本薬学教育学会 2023-08-20
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薬学臨床事前実習における注射剤調製技術の向上を目指したスマートグラスの導入 ENG 日本薬学教育学会 2023-08-20
MDシミュレーションによるGABA
A
受容体のチャネル開閉機構の解明 ENG 日本薬学会第143年会 2023-03-25 ENG 2023-03-29
キナーゼ阻害剤と保存された水分子との相互作用 ENG 日本薬学会第143年会 2023-03-25 ENG 2023-03-29
パーコレーションモデルを用いた感染症の感染規模拡大予測 ENG 日本薬学会第143年会 2023-03-25 ENG 2023-03-29
発熱性感染症流行の予兆検知・警戒システムの開発に向けた新型コロナウイルス感染者数の予測法 ENG 日本薬学会第143年会 2023-03-25 ENG 2023-03-29
計算機を用いたhTRPV1チャネルにおけるカンナビノイドとカプサイシンの結合による構造変化の解析 ENG 日本薬学会第143年会 2023-03-25 ENG 2023-03-29
A generation method for virtual fingerprint datasets with drug-likeness for use in machine learning ENG The Virtual QBIC Workshop 2022 2022-10-12 ENG 2022-10-14
発熱性感染症流行の予兆検知・警戒システムの開発とその取り組みに関して ENG 日本薬学会年会 2022-03
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その他業績
 
特許
 
受賞歴
 
学会活動
 
客員教授
 
researchmap研究分野
 
共同研究テーマ
 
学識経験
 
シーズ集URL
https://www.socu.ac.jp/ebook/seeds2021/?pNo=48