研究者基本情報

• 雨宮　崇之　アメミヤ　タカユキ　Takayuki Amemiya

主な研究課題

• [マルチオミックスデータ解析による創薬研究]<br/>
  一つのオミックス情報のみでは得られない情報や新しい医学的、生物学的知見を得ることができ、近年の大量データ集積によりマルチオミックス解析が実現可能になりました。多数の病状の実験結果から複数のオミックスデータを収集し、データベースを構築、統合的なマルチオミックス解析を行い、新規治療法や創薬につなげる研究を行っています。
• [生体分子の立体構造の網羅的なデータベース解析]
  
  生命の遺伝情報の産物であるタンパク質は合成プロセスや発現される機能より特異な立体構造をしています。世界の公共のデータベースにある大量のタンパク質の立体構造に関する情報を利用し、統計学的なモデルを適用して、タンパク質の立体構造と合成プロセスや機能との相関関係を明らかにすることで創薬研究や生命の理解に役立つことを目指します。

所属

• 山口東京理科大学　工学部数理情報科学科　准教授

研究分野

• オミックス解析　Omics Analysis
• 構造生物学　Structural biology
• 生命情報学　Bioinformatics
• 計算生物学　Computational biology

研究経歴

• 2005/04　～　現在　「分子結合に伴うタンパク質の立体構造変化の研究」に従事
• 2010/11　～　2015/09　「天然変性タンパク質のデータベースIDEALの開発研究」に従事
• 2015/11　～　2020/03　「経産省関連ライフサイエンスポータルサイトMEDALSの開発運営」に従事
• 2015/11　～　現在　「蚊が媒介するウイルス感染症のドラッグリポジショニング法の開発研究」に従事
• 2020/04　～　2023/03　「患者層別化マーカー探索技術の開発／免疫応答モニタリングによるがん免疫の全容理解に基づく新規層別化マーカーの開発」に従事

研究職歴

• 2009　～　2010　横浜市立大学大学院生命ナノシステム科学研究科　勤務（WDB派遣社員として）　Graduate School of Nanobioscience, Yokohama City University, Temporary worker
• 2010　～　2012　名古屋大学大学院情報科学研究科 研究員　Graduate School of Information Science, Nagoya University, Researcher
• 2012　～　2015　名古屋大学大学院情報科学研究科 特任助教　Graduate School of Information Science, Nagoya University, Assistant Professor
• 2015　～　2020　産業技術総合研究所創薬分子プロファイリング研究センター 産総研特別研究員　Molecular Profiling Research Center for Drug Discovery, AIST, Postdoc
• 2020　～　2023　産業技術総合研究所生命工学領域細胞分子工学研究部門　勤務（JBiC特別研究職員として）　Cellular and Molecular Biotechnology Research Institute, AIST, Research Fellow

委員歴／役員歴

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学位

• 横浜市立大学　Yokohama City University　生体超分子科学専攻　Department of Supramolecular Biology　博士（理学）　Ph. D. (Science)

出身大学

• 東京理科大学　Tokyo University of Science　理工学部　Faculty of Science and Engineering　物理学科　Department of Physics　学士課程　卒業
• 横浜市立大学　Yokohama City University　大学院総合理学研究科　Graduate School of Integrated Science　生体超分子システム科学専攻　Science of Biological Supramolecular Systems　博士前期課程　修了
• 横浜市立大学　Yokohama City University　大学院国際総合科学研究科　International Graduate School of Arts and Sciences　生体超分子科学専攻　Department of Supramolcular Biology　博士後期課程　単位取得満期退学（博士（理学）取得）

著作(論文等)

• Protein structural change upon ligand binding correlates with enzymatic reaction mechanism.　J. Mol. Biol.　2008/06
• SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins.　Nucleic Acids Res.　2011/01
• Classification and annotation of the relationship between protein structural change and ligand binding.　J. Mol. Biol.　2011/05
• IDEAL: Intrinsically Disordered proteins with Extensive Annotations and Literature.　Nucleic Acids Res.　2012/01
• PSCDB: a database for protein structural change upon ligand binding.　Nucleic Acids Res.　2012/01

著書

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学会発表

• タンパク質の構造変化データベースの構築と解析　ポスター発表　第43回日本生物物理学会年会　2005/11
• Database analysis of protein structural changes induced by ligand binding　ポスター発表　Fifth East Asian Biophysics Symposium & Forty-Fourth Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan　2006/11
• 線形応答理論によるタンパク質構造変化のデータベース解析　口頭発表（一般）　第45回日本生物物理学会年会　2007/12
• 構造変化から見たタンパク質－タンパク質間相互作用の相違　ポスター発表　第45回日本生物物理学会年会　2007/12
• 低分子リガンド結合に関わるタンパク質構造変化のデータベース解析：結晶場の影響　口頭発表（一般）　第8回日本蛋白質科学会年会　2008/06

その他業績

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特許

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受賞歴

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学会活動

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客員教授

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共同研究テーマ

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学識経験

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外部リンク

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